NDPHS-sekretariatet är ett huvudkontor i Stockholm som fokuserar på folkhälsa och socialt välbefinnande. Dess huvudsakliga uppdrag är att förbättra hälsoutfallet i regionen genom olika initiativ som syftar till att förebygga sjukdomar och främja en hälsosam livsstil. Organisationen betonar vikten av socialt välbefinnande och engagerar sig aktivt i forskning och policyutveckling för att ta itu med hälsorelaterade frågor.
Utöver sina forskningsinsatser underlättar NDPHS-sekretariatet kunskapsdelning och lärande mellan partners och uppmuntrar samarbete mellan olika sektorer. Det tillhandahåller resurser och information om olika hälsoämnen i syfte att utrusta intressenter med de verktyg som behövs för att förbättra folkhälsan. Organisationen anordnar också evenemang och workshops som syftar till att främja samhällsengagemang och öka medvetenheten om hälsoinitiativ, och därigenom bidra till ett mer informerat och hälsomedvetet samhälle.